教授 松藤　千弥教授写真
准教授 村井　法之
講師 小黒　明広
助教 大城戸　真喜子
田島　彩沙
研究生 畑中　洋亮
訪問研究員 川喜田　正夫
研究補助員

寺崎　早苗
澤田　理恵
 
講座（研究室）の概要
1975年　4月　栄養学教室に 林 伸一 教授が着任
1995年　4月　生化学講座第２に名称変更
2007年　4月　分子生物学講座に名称変更
2007年　5月　松藤 千弥 が講座担当教授に着任
医学科教育について
　分子生物学講座では、生化学講座と連携して、医学科2年前期の「分子から生命へ」を中心に、1年から3年までの準備教育・基礎教育を担当しています。生命分子に親しみと興味を持ってもらうことが一番の目標です。
大学院教育・研究について
　細胞の働きに欠かせないポリアミン、またその制御に関わるアンチザイムやアンチザイムインヒビターなどの生命分子の「機能」に焦点を当てた医学・生物学の研究に興味がある方を、医学部卒業生だけでなく、広く他学部からも募集しています。
講座(研究室)からのメッセージ
　私たちの研究を是非のぞきに来てください。学生のうちから自主的に研究を始める方も大歓迎です。
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教育担当
講義科目名称と対象学年

・コース基礎医科学�� ユニット「分子から生命へ」（医学科2年）
・コース基礎医科学�� ユニット「自然と生命の理」（医学科2年）
・コース基礎医科学�� ユニット「泌尿器系」（医学科2年）
・看護専門基礎・人間と健康「生化学」（看護学科2年）

実習科目名称と対象学年
・コース医学総論�� ユニット「医学総論�輝藹�」（医学科1年）
・コース生命基礎科学 ユニット生命基礎科学実習・生物系（医学科1年）
・コース基礎医科学�� ユニット「分子から生命へ演習」（医学科2年）
・コース基礎医科学�� ユニット「分子から生命へ実習」（医学科2年）
・コース基礎医科学�� ユニット「自然と生命の理演習」（医学科2年）
・コース基礎医科学�� ユニット「症候病態演習�機廖憤絣慍�2年）
・コース臨床基礎医学 ユニット「症候病態演習�供廖憤絣慍�3年）
・コース外国語�� ユニット「医学英語専門文献抄読�機廖憤絣慍�3年）
・コース臨床基礎医学 ユニット「研究室配属」（医学科3年）

・大学院医学系専攻 共通カリキュラム 「医の倫理」（大学院）
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大学院担当科目名称
大学院ガイド授業細目　　生化学・分子機能学（64ページ）をご参照ください
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主な研究テーマ
ポリアミン調節タンパク質「アンチザイム」に関する研究
  1. アンチザイム2によるMycタンパク質のユビキチン非依存的分解とがん細胞増殖の関連
  2. アンチザイム1, 2に特異的に相互作用する分子の同定と機能解析
  3. アンチザイムによるATPクエン酸リアーゼの調節機構
  4. ポリアミンによるアンチザイムmRNAの翻訳フレームシフト促進機構の解明
ポリアミンの機能解析とポリアミンを利用した医療応用へ向けた研究
  1. ポリアミンの生理機能の解析
  2. ポリアミンによる翻訳制御機構の解析
  3. ポリアミンの診断応用
  4. ポリアミンとがん：腫瘍マーカーとしての尿中ジアセチルスペルミン
  5. RNAアプタマーを応用したRNA構造に対するポリアミン作用の解析
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主な業績
［英語原著論文］
  1. Yogosawa S, Ohkido M, Horii T, Okazaki Y, Nakayama J, Yoshida S, Toyokuni S, Hatada I, Morimoto M, Yoshida K. Mice lacking DYRK2 exhibit congenital malformations with lung hypoplasia and altered Foxf1 expression gradient. Commun Biol. 2021; 4(1): 1204
  2. Li Y, Tajima A, Mattie FJ, Green MH, Ross AC. Pregnancy and lactation alter Vitamin A metabolism and kinetics in rats under Vitamin A adequate dietary conditions. Nutrients. 2021; 13(8): 2853
  3. Oguro A, Shigeta T, Machida K, Suzuki T, Iwamoto T, Matsufuji S, Imataka H.Transalation efficiency affects the sequence-independent + 1 ribosomal frameshifting by polyamines. J Biochem. 2020; doi: 10.1093/jb/mvaa032.
  4. Murai N.
    Ubiquitin-independent proteasomal degradation mediated by antizyme. Book chapter published 2020; In Zhan X ed. Ubiquitin Proteasome Pathway. IntechOpen. doi:10.5772/intechopen.92623
  5. Katagiri S, Hosono K, Hayashi T, Murai N, Wake E, Miyata I, Mizobuchi K, Kurata K, Matsuura T, Nakano T, Hatta Y. Novel biallelic splice-site BBS1 variants in Bardet-Biedle syndrome: a case report of the first Japanese patient. Doc Ophthalmol.2020; 13051. doi: 10.1007/s10633-020-09752-5.
  6. Fujimi TJ, Mezaki Y, Masaki T, Tajima A, Nakamura M, Yoshikawa A, Murai N, Aizawa M, Kojima S, Matsumoto Y, Aizaki H, Matsuura T. Investigation of the effects of urea cycle amino acids on the expression of ALB and CEBPB in the human hepatocellular carcinoma cell line FLC-4. Hum Cell. 2020; 33 (3):590-8.
  7. Tamari K, Konno M, Asai A, Koseki J, Hayashi K, Kawamoto K, Murai N, Matsufuji S, Isohashi F, Satoh T, Goto N, Tanaka S, Doki Y, Mori M, Ogawa K, Ishii H. Polyamine flux suppresses histone lysine demethylases and enhances ID1 expression in cancer stem cells. Cell Death Discov. 2018 4:104
  8. Katagiri S, Hayashi T, Yoshitake K, Murai N, Matsui Z, Kubo H, Satoh H, Matsufuji S, Takamura T, Yokoo T, Omori Y, Furukawa T, Iwata T, Nakano T. Compound heterozygous splice site variants in the SCLT1 gene highlight an additional candidate locus for Senior-Løken syndrome. Sci Rep. 2018 13:16733.
  9. Yamamoto Y, Makino T, Kudo H, Ihn H, Murakami Y, Matsufuji S, Fujiwara K, Shin M. Expression and distribution patterns of spermine, spermidine, and putrescine in rat hair follicle. Histochem Cell Biol. 2018; 149(2): 161-7.
  10. Murai N, Murakami Y, Tajima A, Matsufuji S. Novel ubiquitin-independent uncleolar c-Myc degradation pathway mediated by antizyme 2. Sci. Rep. 2018; 8 (1): 3005.
  11. Oguro A, Yanagida A, Fujieda Y, Amano R, Otsu M, Sakamoto T, Kawai G, Matsufuji S. Two stems with different characteristics and an internal loop in an RNA aptamer contribute to spermine-binding. J Biochem. 2017; 161: 197-206.
  12. Jaafar ZA, Oguro A, Nakamura Y, Kieft JS. Translation initiation by the hepatitis C virus IRES requires eIF1A and ribosomal complex remodeling. eLife. 2016; 5: e21198.
  13. Tajima A, Murai N, Murakami Y, Iwamoto T, Migita T, Matsufuji S. Polyamine regulating protein antizyme binds to ATP citrate lyase to accelerate acetyl-CoA production in cancer cells. Biochem Biophys Res Commun. 2016; 471(4): 646-51.
  14. Murai N. Antizyme. In Kusano T, Suzuki H eds. Polyamines, a universal molecular nexus for growth, survival and specialized metabolism. Springer, New York; 2015. : 91-9.
  15. Murakami Y, Ohkido M, Takizawa H, Murai N, Matsufuji S. Multiple forms of mouse antizyme inhibitor 1 mRNA differentially regulated by polyamines. Amino Acids. 2014; 46(3): 575-83.
  16. Matoba K, Kawanami D, Tsukamoto M, Kinoshita J, Ito T, Ishizawa S, Kanazawa Y, Yokota T, Murai N, Matsufuji S, Utsunomiya K. Rho-kinase regulation of TNF-α-induced nuclear translocation of NF-κB RelA/p65 and M-CSF expression via p38 MAPK in mesangial cells. Am J Physiol Renal Physiol. 2014; 307: F571-80.
  17. Hirata Y, Murai N, Yanaihara N, Saito M, Saito M, Urashima M, Murakami Y, Matsufuji S, Okamoto A. MicroRNA-21 is a candidate driver gene for 17q23-25 amplification in ovarian clear cell carcinoma. BMC Cancer. 2014; 14: 799.
  18. Matoba K, Kawanami D, Okada R, Tsukamoto M, Kinoshita J, Ito T, Ishizawa S, Kanazawa Y, Yokota T, Murai N, Matsufuji S, Takahashi-Fujigasaki J, Utsunomiya K. Rho-kinase inhibition prevents the progression of diabetic nephropathy by downregulating hypoxia-inducible factor 1α. Kidney Int. 2013; 84: 545-54.
  19. Murai N, Murakami Y, Matsufuji S. Protocols for studying antizyme expression and function. Methods Mol Biol. 2011; 720: 237-67.
  20. Ivanov IP, Matsufuji S. Autoregulatory frameshifting in antizyme gene expression governs polyamine levels from yeast to mammals. In Atkins JF, Gesteland RF eds. Recoding: Nucleic Acids and Molecular Biology 24. Springer, New York; 2010: 281-300.
  21. Murai N, Shimizu A, Murakami Y, Matsufuji S. Subcellular localization and phosphorylation of antizyme 2. J Cell Biochem. 2009; 108(4): 1012-21.
  22. Horiya S, Inaba M, Koh CS, Uehara H, Masui N, Mizuguchi M, Ishibashi M, Matsufuji S, Harada K. Replacement of the lambda boxB RNA-N peptide with heteros RNA-peptide interactions relaxes the strict spatial requirements for the formation of a transcription anti-termination complex. Mol Microbiol. 2009; 74(1): 85-97.
  23. Murakami Y, Suzuki J, Samejima K, Kikuchi K, Hascilowicz T, Murai N, Matsufuji S, Oka T. The change of antizyme inhibitor expression and its possible role during mammalian cell cycle. Exp Cell Res. 2009; 315: 2301-11.
  24. Oguro A, Ohtsu T, Nakamura Y. An aptamer-based biosensor for mammalian initiation factor eukaryotic initiation factor 4A. Anal Biochem. 2009; 388(1): 102-7.
  25. Liao CP, Lasbury ME, Wang SH, Zhang C, Durant PJ, Murakami Y, Matsufuji S, Lee CH. Pneumocystis mediates overexpression of antizyme inhibitor resulting in increased polyamine levels and apoptosis in alveolar macrophages. J Biol Chem. 2009; 284(12): 8174-84.
  26. Tang H, Ariki K, Ohkido M, Murakami Y, Matsufuji S, Li Z, Yamamura K. Role of ornithine decarboxylase antizyme inhibitor in vivo. Genes Cells. 2009; 14(1): 79-87.
  27. Horiya S, Koh CS, Matsufuji S, Harada K. Analysis of the interaction between selected RNA-binding peptides and a target RNA containing a bulge and a GNRA-type tetraloop. Nucleic Acids Symp Ser (Oxf). 2008; (52): 209-10.
  28. Namy O, Galopier A, Martini C, Matsufuji S, Fabret C, Rousset JP. Epigenetic control of polyamines by the prion [PSI(+)]. Nat Cell Biol. 2008; 10(9): 1069-75.
  29. Isome M, Lortie MJ, Murakami Y, Parisi E, Matsufuji S, Satriano J. The antiproliferative effects of agmatine correlate with the rate of cellular proliferation. Am J Physiol Cell Physiol. 2007; 293(2): C705-11.
  30. Kosuge M, Takizawa H, Maehashi H, Matsuura T, Matsufuji S. A comprehensive gene expression analysis of human hepatocellular carcinoma cell lines as components of a bioartificial liver using a radial flow bioreactor. Liver Int. 2007; 27(1): 101-8.
  31. Yamaguchi Y, Takatsuka Y, Matsufuji S, Murakami Y, Kamio Y. Characterization of a counterpart to Mammalian ornithine decarboxylase antizyme in prokaryotes. J Biol Chem. 2006; 281(7): 3995-4001.
  32. Watanabe M, Konishi M, Ohkido I, Matsufuji S. Enhanced sodium-dependent extrusion of magnesium in mutant cells established from a mouse renal tubular cell line. Am J Physiol Renal Physiol. 2005; 289(4): F742-8.
  33. Nakamatsu Y, Matsufuji S. Selection of translational frameshift signals in E. coli. Jikeikai Med J. 2004; 51(4): 113-21.
  34. Higashi K, Yoshida K, Nishimura K, Momiyama E, Kashiwagi K, Matsufuji S, Shirahata A, Igarashi K. Structural and functional relationship among diamines in terms of inhibition of cell growth. J Biochem (Tokyo). 2004; 36(4): 533-9.
  35. Shinoda M, Tanaka Y, Kuno T, Matsufuji T, Matsufuji S, Murakami Y, Mizutani T. High levels of autoantibodies against drug-metabolizing enzymes in SLA/LP-positive AIH-1 sera. Autoimmunity. 2004; 37(6-7): 473-80.
  36. Matveeva OV, Foley BT, Nemtsov VA, Gesteland RF, Matsufuji S, Atkins JF, Ogurtsov AY, Shabalina SA. Identification of regions in multiple sequence alignments thermodynamically suitable for targeting by consensus oligonucleotides: application to HIV genome. BMC Bioinformatics. 2004; 5: 44.
  37. Karamysheva ZN, Karamyshev AL, Ito K, Yokogawa T, Nishikawa K, Nakamura Y, Matsufuji S. Antizyme frameshifting as a functional probe of eukaryotic translational termination. Nucleic Acids Res. 2003; 31(20): 5949-56.
  38. Murai N, Murakami Y, Matsufuji S. Identification of nuclear export signals in antizyme-1. J Biol Chem. 2003; 278(45): 44791-8.
  39. Yanaihara N, Okamoto A, Matsufuji S. A commonly deleted region in ovarian cancer on chromosome 19p13.3, not including the OAZ1 gene. Int J Oncol. 2003; 23(3): 567-75.
  40. Hascilowicz T, Murai N, Matsufuji S, Murakami Y. Regulation of ornithine decarboxylase by antizymes and antizyme inhibitor in zebrafish (Danio rerio). Biochim Biophys Acta. 2002; 1578(1-3): 21-8.
  41. Atkins JF, Baranov PV, Fayet O, Herr AJ, Howard MT, Ivanov IP, Matsufuji S, Miller WA, Moore B, Prère MF, Wills NM, Zhou J, Gesteland RF. Overriding standard decoding: implications of recoding for ribosome function and enrichment of gene expression. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2001; 66: 217-32.
  42. Howard MT, Shirts BH, Zhou J, Carlson CL, Matsufuji S, Gesteland RF, Weeks RS, Atkins JF. Cell culture analysis of the regulatory frameshift event required for the expression of mammalian antizymes. Genes Cells. 2001; 6(11): 931-41.
  43. Chattopadhyay MK, Murakami Y, Matsufuji S. Antizyme regulates the degradation of ornithine decarboxylase in fission yeast Schizosaccharomyces pombe. Study in the spe2 knockout strains. J Biol Chem. 2001; 276(24): 21235-41.
  44. Kim LK, Matsufuji T, Matsufuji S, Carlson BA, Kim SS, Hatfield DL, Lee BJ. Methylation of the ribosyl moiety at position 34 of selenocysteine tRNA[Ser]Sec is governed by both primary and tertiary structure. RNA. 2000; 6(9): 1306-15.
  45. Ivanov IP, Matsufuji S, Murakami Y, Gesteland RF, Atkins JF. Conservation of polyamine regulation by translational frameshifting from yeast to mammals. EMBO J. 2000; 19(8): 1907-17.
  46. Murakami Y, Matsufuji S, Hayashi S, Tanahashi N, Tanaka K. Degradation of ornithine decarboxylase by the 26S proteasome. Biochem Biophys Res Commun. 2000; 267(1): 1-6. Review.
  47. Saito T, Hascilowicz T, Ohkido I, Kikuchi Y, Okamoto H, Hayashi S, Murakami Y, Matsufuji S. Two zebrafish (Danio rerio) antizymes with different expression and activities. Biochem J. 2000; 345 Pt 1: 99-106.
［日本語論文・著書］
  1. 村井　法之．ヒトの細胞と分子基盤　細胞の発生．翻訳．In 栗原敏（監修）リッピンコットシリーズ　イラストレテッド統合臨床基礎医学．2018: 1-7. 医学書院.
  2. 村井　法之．アンチザイム（シリーズ　ポリアミン研究）．日本ポリアミン学会． 2017; 4 (1): 8-13.
  3. 大城戸　真喜子．「次世代を育てる」医学生・看護学生への試み〜ロービジョン者の抱える問題に気づき､想像し､解決する方法を考える機会としてのロービジョン教育〜．眼科臨床紀要．2016; 9: 113-9.
  4. 松藤　千弥．研究はなんのためにあるのだろう．In 栗原敏（監修）医療入門．2006: 122-128. 医学書院.
  5. 松藤　千弥．拡がりをみせる細胞遺伝子のリコーディング．実験医学別冊．2004; 22 (17) : 2461-2468. 羊土社.
  6. 松藤　千弥，稲田利文．ゲノムからみた翻訳とRNAの品質管理．ゲノム医学．2004; 4 (4): 377-383. メジカルレビュー社.
  7. 松藤　千弥．タンパク質生合成．In 中村義一編．RNAがわかる．2003: 59-69. 羊土社.
  8. 村上　安子，松藤　千弥．迅速なポリアミン制御を可能にするオルニチン脱炭酸酵素の分解系．化学と生物． 2001; 39 (3): 171-176.
  9. 村上　安子，松藤　千弥．オルニチン脱炭酸酵素とアンチザイム．実験医学．2001; 19 (2): 173−179.
  10. 松藤　千弥，藤原俊伸，中村義一．リコーディング．In 志村令郎，渡辺公綱編．RNA研究の最前線．2000: 139−144. シュプリンガー・フェアラーク東京，東京.
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主な競争的研究費
  • 科学研究費助成事業・基盤研究（C）. 2022〜2024年度
    「ポリアミンが誘導するリピート病の発症機構とその制御による病態抑制効果の解明」 （代表：小黒明広）

  • 科学研究費助成事業・若手研究. 2022〜2023年度
    「ドコサヘキサエン酸の酸化代謝物による抗動脈硬化作用の分子生物学的機序の解析」（代表：田島彩紗）
 
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その他
【社会的活動】

日本生化学会・評議員（松藤）
日本ポリアミン学会会長（松藤）
日本ポリアミン学会・評議員（松藤、村井）
日本ポリアミン学会事務局 庶務（村井）、広報（小黒）、会計（大城戸）
日本ポリアミン学会・企画運営委員会（小黒、村井、大城戸）
日本安定同位体・生体ガス医学応用学会・評議員（松藤）
文部科学省科学技術政策研究所科学技術動向研究センター・専門調査員（松藤）
公益財団法人微生物化学研究会・評議員（松藤）
共立女子大学看護学部非常勤講師（村井）
工学院大学先進工学部非常勤講師（村井）
日本女子大学理学部非常勤講師（村井）
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講座（研究室）独自のホームページURL
東京慈恵会医科大学　分子生物学講座
http://www.jikei.ac.jp/mb/
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