教授 金城 雄樹教授写真
准教授 岩瀬 忠行
杉本 真也
講師 田嶌 亜紀子
奥田 賢一
助教 千葉 明生
訪問研究員 林 浩史
日本学術振興会
特別研究員(PD)
吉井 悠
大学院生 米本 圭吾
講座(研究室)の概要
 細菌学講座は1910年に設立され、2010年で100周年を迎えました。2018年7月より現教授が講座を主宰しています。細菌学講座では、主にバイオフィルム感染症の制圧を目指した研究、細菌感染症に対する防御免疫機構の研究および新規ワクチンの開発研究を行っています。
医学科教育について
 細菌・真菌と感染、感染症総論の講義では、病原細菌および病原真菌による感染症成立機序および感染制御の方策について理解をしてもらうことを目指しています。 細菌学実習では、無菌操作やグラム染色法の習得、薬剤感受性検査、細菌の採取・同定などを行っています。 感染・免疫テュートリアルでは、臨床症例の病態理解・症候へのアプローチを可能とする能力を養うことや、グループ学習を通じて討論ならびにコミュニケーション技法を身につけることを目指しています。 研究室配属、選択実習では実験手技の習得、データの解析および発表能力を身につけることを目指しています。
大学院教育・研究について
 大学院教育においては、研究基盤となる様々な実験手法や考え方を教授するとともに、研究テーマに関連した最新の情報や論文を紹介し、研究結果の解釈および批判する能力を養い、論文作成に活かせるように指導しています。研究においては、細菌の病原因子の発現機構や生存戦略の解析を行っています。主な研究テーマとしてバイオフィルム感染症の制圧を目指した研究を行っており、バイオフィルムの構造や形成メカニズムの解析を行うとともに、バイオフィルム形成を阻害する薬剤の探索を行っています。また、細菌感染症に対する防御免疫機構の解析を行っています。主な研究テーマとして、細菌感染防御に重要な抗体産生メカニズムの解析や新規ワクチンの開発研究を展開しています。
講座(研究室)からのメッセージ
 細菌感染症や真菌感染症の病態解明を目的として研究に取り組むとともに、研究成果が疾病の治療や予防に繋がることを目指して研究を展開したいと考えています。その観点に基づき臨床の先生方と連携して、研究を推進したいと思っています。
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教育担当
講義科目名称と対象学年
臨床基礎医学(医学科3年) ユニット「細菌・真菌と感染」、「感染症総論」
実習科目名称と対象学年

細菌学実習(医学科3年)
研究室配属(医学科3年)
選択実習(医学科6年)
感染・免疫テュートリアル(医学科3年)

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大学院担当科目名称
病態解析・生体防御学> 細菌学
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主な研究テーマ
実験研究
新規肺炎球菌ワクチンの開発
細菌感染防御に重要な抗体の産生誘導メカニズムの研究
黄色ブドウ球菌・大腸菌のバイオフィルム形成機構の解明およびバイオフィルム形成を阻害する薬剤の開発
大気圧走査電子顕微鏡(ASEM)を用いた微生物の構造解析
バイオフィルム感染症によるアミロイドーシス発症メカニズムの解明
8型分泌装置の作動原理および生理機能の解明
VNC(viable but nonculturable:生きているが培養できない)病原細菌の分子メカニズムに関する研究
腸内細菌が宿主窒素代謝に与える影響
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主な業績

1. Kinjo Y, Takatsuka S, Kitano N, Kawakubo S, Abe M, Ueno K, Miyazaki Y:

Functions of CD1d-Restricted Invariant Natural Killer T Cells in Antimicrobial Immunity and Potential Applications for Infection Control. Front Immunol. 9:1266, Jun. 2018

2. Sugimoto S, Arita-Morioka K, Terao A, Yamanaka K, Ogura T, Mizunoe Y:

Multitasking of Hsp70 chaperone in the biogenesis of bacterial functional amyloids. Commun Biol. 1, Article number: 52, May. 2018

3. Arita-Morioka K, Yamanaka K, Mizunoe Y, Tanaka Y, Ogura T, Sugimoto S:

Inhibitory effects of Myricetin derivatives on curli-dependent biofilm formation in Escherichia coli. Sci Rep. 8(1): 8452, May. 2018

4. Ikeda-Dantsuji Y, Nakamura S, Ohno H, Inukai T, Nagi M, Ueno K, Umeyama T, Kinjo Y, Yamagoe S, Shibuya K, Miyazaki Y. Intraspecies variation in the efficacy of adjunctive recombinant interferon-γ therapy against cryptococcal meningoencephalitis in mice. Med Mycol. 56(3):382-386. Apr. 2018

5. Iwase T, Okai C, Kamata Y, Tajima A, Mizunoe Y: A straightforward assay for measuring glycogen levels and RpoS. J Microbiol Methods. 145: 93-7, Feb. 2018

6. Sugimoto S, Sato F, Miyakawa R, Chiba A, Onodera S, Hori S, Mizunoe Y: Broad impact of extracellular DNA on biofilm formation by clinically isolated Methicillin-resistant and -sensitive strains of Staphylococcus aureus. Sci Rep. 8(1): 2254, Feb. 2018

7. Okuda K, Nagahori R, Yamada S, Sugimoto S, Sato C, Sato M, Iwase T, Hashimoto K, Mizunoe Y: The Composition and Structure of Biofilms Developed by Propionibacterium acnes Isolated from Cardiac Pacemaker Devices. Front Microbiol. 9: 182, Feb. 2018

8. Kanematsu H, Barry DM, Ikegai H, Yoshitake M, Mizunoe Y: Biofilm evaluation methods outside body to inside - Problem presentations for the future -. Medical Research Archives. 5 (8): 1-17, Aug. 2017

9. Yoshii Y, Okuda K, Yamada S, Nagakura M, Sugimoto S, Nagano T, Okabe T, Kojima H, Iwamoto T, Kuwano K, Mizunoe Y: Norgestimate inhibits staphylococcal biofilm formation and resensitizes methicillin-resistant Staphylococcus aureus to β-lactam antibiotics. NPJ Biofilms Microbiomes.3: 18, Jul 2017

10. Izawa K, Maehara A, Isobe M, Yasuda Y, Urai M, Hoshino Y, Ueno K, Matsukawa T, Takahashi M, Kaitani A, Shiba E, Takamori A, Uchida S, Uchida K, Maeda K, Nakano N, Yamanishi Y, Oki T, Voehringer D, Roers A, Nakae S, Ishikawa J, Kinjo Y, Shimizu T, Ogawa H, Okumura K, Kitamura T, Kitaura J. Disrupting ceramide-CD300f interaction prevents septic peritonitis by stimulating neutrophil recruitment. Sci Rep. 7(1): 4298. Jun 2017

11. Ueno K, Urai M, Takatsuka S, Abe M, Miyazaki Y, Kinjo Y. Immunization with Antigen-Pulsed Dendritic Cells Against Highly Virulent Cryptococcus gattii Infection: Analysis of Cytokine-Producing T Cells. Methods Mol Biol. 1625:327-339. Jun 2017.

12. Sato C, Kinoshita T, Memtily N, Sato M, Nishihara S, Yamazawa T, Sugimoto S: Correlative light-electron microscopy in liquid using an inverted SEM (ASEM). Methods Cell Biol. 140: 187-213. May 2017.

13. Iwase T, Matsuo T, Nishioka S, Tajima A, Mizunoe Y. Hydrophobicity of Residue 128 of the Stress-Inducible Sigma Factor RpoS Is Critical for Its Activity. Front Microbiol. 8: 656, Apr 2017.

14. Iwase T, Ogura Y, Hayashi T, Mizunoe Y. Complete Genome Sequence of Klebsiella oxytoca Strain JKo3. Genome Announc. 4(6): pii: e01221-16, Nov 2016.

15. Sugimoto S, Okuda K, Miyakawa R, Sato M, Arita-Morioka K, Chiba A, Yamanaka K, Ogura T, Mizunoe Y, Sato C. Imaging of bacterial multicellular behaviour in biofilms in liquid by atmospheric scanning electron microscopy. Sci Rep. 6: 25889, May 2016.

16. Iwase T, Ogura Y, Hayashi T, Mizunoe Y. Complete genome sequence of Klebsiella pneumoniae YH43. Genome Announc. 4 (2): pii: e00242-16, Apr 2016.

17. Ueno K, Urai M, Ohkouchi K, Miyazaki Y, Kinjo Y. Dendritic Cell-Based Vaccine Against Fungal Infection. Methods Mol Biol.;1403: 537-49. Apr 2016.

18. Urai M, Kaneko Y, Ueno K, Okubo Y, Aizawa T, Fukazawa H, Sugita T, Ohno H, Shibuya K, Kinjo Y, Miyazaki Y. Evasion of Innate Immune Responses by the Highly Virulent Cryptococcus gattii by Altering Capsule Glucuronoxylomannan Structure. Front Cell Infect Microbiol. 5: 101. Jan 2016.

19. Akahori Y, Miyasaka T, Toyama M, Matsumoto I, Miyahara A, Zong T, Ishii K, Kinjo Y, Miyazaki Y, Saijo S, Iwakura Y, Kawakami K. Dectin-2-dependent host defense in mice infected with serotype 3 Streptococcus pneumoniae. BMC Immunol. 17: 1, Jan 2016.

20. Sugimoto S, Arita-Morioka KI, Mizunoe Y, Yamanaka K, Ogura T. Thioflavin T as a fluorescence probe for monitoring RNA metabolism at molecular and cellular levels. Nucleic Acids Res. 43(14): e92, Aug 2015.

21. Koyama R, Okuda K, Matsushita K, Beppu M, Mizunoe Y. Antimicrobial and antibiofilm effects of ozonated water for prevention and treatment of bone and joint infections. J. St. Marianna Univ. 6 (1): p1-7, Jun 2015.

22. Chiba A, Sugimoto S, Sato F, Hori S, Mizunoe Y. A refined technique for extraction of extracellular matrixes from bacterial biofilms and applicability. Microb Biotechnol. 8(3): 392-403, May 2015.

23. Ueno K, Kinjo Y, Okubo Y, Aki K, Urai M, Kaneko Y, Shimizu K, Wang DN, Okawara A, Nara T, Ohkouchi K, Mizuguchi Y, Kawamoto S, Kamei K, Ohno H, Niki Y, Shibuya K, Miyazaki Y. Dendritic cell-based immunization ameliorates pulmonary infection with highly virulent Cryptococcus gattii. Infect Immun. 83(4): 1577-86, Apr 2015.

24. Arita-Morioka K, Yamanaka K, Mizunoe Y, Ogura T, Sugimoto S. A novel strategy for biofilm inhibition by using small molecules targeting molecular chaperone DnaK. Antimicrob Agents Chemother. 59(1): 633-41, Jan 2015.

25. Shimizu K, Sato Y, Shinga J, Watanabe T, Endo T, Asakura M, Yamasaki S, Kawahara K, Kinjo Y, Kitamura H, Watarai H, Ishii Y, Tsuji M, Taniguchi M, Ohara O, 26. Fujii S. KLRG+ invariant natural killer T cells are long-lived effectors. Proc Natl Acad Sci U S A. 111(34): 12474-9. Aug 2014.

27. Kinoshita T, Mori Y, Hirano K, Sugimoto S, Okuda K, Matsumoto S, Namiki T, Ebihara T, Kawata M, Nishiyama H, Sato M, Suga M, Higashiyama K, Sonomoto K, Mizunoe Y, Nishihara S, Sato C. Immuno-electron microscopy of primary cell cultures from genetically modified animals in liquid by atmospheric scanning electron microscopy. Microsc Microanal. 20(2): 469-83. Apr 2014.

28. Tarumoto N, Kinjo Y, Kitano N, Sasai D, Ueno K, Okawara A, Izawa Y, Shinozaki M, Watarai H, Taniguchi M, Takeyama H, Maesaki S, Shibuya K, Miyazaki Y. Exacerbation of invasive Candida albicans infection by commensal bacteria or a glycolipid through IFN-γ produced in part by iNKT cells. J Infect Dis. 209(5): 799-810. Mar 2014.

29. Okuda K, Zendo T, Sugimoto S, Iwase T, Tajima A, Yamada S, Sonomoto K, Mizunoe Y. Effects of bacteriocins on methicillin-resistant Staphylococcus aureus biofilm. Antimicrob Agents Chemother. 57(11): 5572-9. Nov 2013.

30. Iwase T, Tajima A, Sugimoto S, Okuda K, Hironaka I, Kamata Y, Takada K, Mizunoe Y. A simple assay for measuring catalase activity: a visual approach. Sci Rep. 3: 3081. Oct 2013.

31. Hironaka I, Iwase T, Sugimoto S, Okuda K, Tajima A, Yanaga K, Mizunoe Y. Glucose triggers ATP secretion from bacteria in a growth-phase-dependent manner. Appl Environ Microbiol. 79(7): 2328-35. Apr 2013.

32. Sugimoto S, Iwamoto T, Takada K, Okuda K, Tajima A, Iwase T, Mizunoe Y. Staphylococcus epidermidis Esp degrades specific proteins associated with Staphylococcus aureus biofilm formation and host-pathogen interaction. J Bacteriol. 195(8): 1645-55. Apr 2013.

33. Iwamura C, Shinoda K, Endo Y, Watanabe Y, Tumes DJ, Motohashi S, Kawahara K, Kinjo Y, Nakayama T. Regulation of memory CD4 T-cell pool size and function by natural killer T cells in vivo. Proc Natl Acad Sci U S A. 109(42): 16992-7. Oct 2012.

34. Sugimoto S, Iwase T, Sato F, Tajima A, Shinji H, Mizunoe Y. Cloning, expression and purification of extracellular serine protease Esp, a biofilm-degrading enzyme, from Staphylococcus epidermidis. J Appl Microbiol. 111(6): 1406-15. Dec 2011.

35. Girardi E, Yu ED, Li Y, Tarumoto N, Pei B, Wang J, Illarionov P, Kinjo Y, Kronenberg M, Zajonc DM. Unique interplay between sugar and lipid in determining the antigenic potency of bacterial antigens for NKT cells. PLoS Biol.9(11): e1001189. Nov 2011.

36. Kinjo Y, Illarionov P, Vela JL, Pei B, Girardi E, Li X, Li Y, Imamura M, Kaneko Y, Okawara A, Miyazaki Y, Gomez-Velasco A, Rogers P, Dahesh S, Uchiyama S, Khurana A, Kawahara K, Yesilkaya H, Andrew PW, Wong CH, Kawakami K, Nizet V, Besra GS, Tsuji M, Zajonc DM, Kronenberg M. Invariant natural killer T cells recognize glycolipids from pathogenic Gram-positive bacteria. Nat Immunol. 12(10): 966-74. Sep 2011.

37. Shinji H, Yosizawa Y, Tajima A, Iwase T, Sugimoto S, Seki K, Mizunoe Y. Role of fibronectin-binding proteins A and B in in vitro cellular infections and in vivo septic infections by Staphylococcus aureus. Infect Immun. 79(6): 2215-23. Jun 2011.

38. Iwase T, Uehara Y, Shinji H, Tajima A, Seo H, Takada K, Agata T, Mizunoe Y. Staphylococcus epidermidis Esp inhibits Staphylococcus aureus biofilm formation and nasal colonization. Nature. 465(7296): 346-9. May 2010.

39. Wang J, Li Y, Kinjo Y, Mac TT, Gibson D, Painter GF, Kronenberg M, Zajonc DM. Lipid binding orientation within CD1d affects recognition of Borrelia burgorferi antigens by NKT cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 107(4): 1535-40. Jan 2010.

40. Tupin E, Benhnia MR, Kinjo Y, Patsey R, Lena CJ, Haller MC, Caimano MJ, Imamura M, Wong CH, Crotty S, Radolf JD, Sellati TJ, Kronenberg M. NKT cells prevent chronic joint inflammation after infection with Borrelia burgdorferi. Proc Natl Acad Sci U S A. 105(50): 19863-8. Dec 2008.

41. Tupin E, Kinjo Y, Kronenberg M. The unique role of natural killer T cells in the response to microorganisms. Nat Rev Microbiol. 5(6): 405-17. Jun 2007.

42. Kinjo Y, Tupin E, Wu D, Fujio M, Garcia-Navarro R, Benhnia MR, Zajonc DM, Ben-Menachem G, Ainge GD, Painter GF, Khurana A, Hoebe K, Behar SM, Beutler B, Wilson IA, Tsuji M, Sellati TJ, Wong CH, Kronenberg M. Natural killer T cells recognize diacylglycerol antigens from pathogenic bacteria. Nat Immunol. 7(9): 978-86. Sep 2006.

43. Kinjo Y, Wu D, Kim G, Xing GW, Poles MA, Ho DD, Tsuji M, Kawahara K, Wong CH, Kronenberg M. Recognition of bacterial glycosphingolipids by natural killer T cells.Nature. 434(7032): 520-5. Mar 2005.

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主な競争的研究費

○文部科学省科学研究費補助金・基盤研究(B)「糖脂質を用いた新規ワクチンによる肺炎球菌感染防御機構の解明」

○文部科学省科学研究費補助金・基盤研究(C)「バイオフィルム離脱細菌の解析と治療への応用」

○文部科学省科学研究費補助金・挑戦的萌芽研究「採食行動の進化における腸内細菌の役割」

○文部科学省科学研究費補助金・若手研究(A)「バイオフィルムマトリクス成分の新機能の開拓」

○文部科学省科学研究費補助金・若手研究「納豆菌を活用した病原細菌の制御法の開発」

○文部科学省科学研究費補助金・特別研究員奨励費「黄色ブドウ球菌のバイオフィルム形成を阻害する低分子化合物の作用機序解析」

○国立研究開発法人 日本医療研究開発機構「ユニバーサル肺炎球菌ワクチンの創出研究」

○国立研究開発法人 科学技術振興機構・ERATO「大気圧走査電子顕微鏡(ASEM)を用いた複合微生物集団の構造と機能の統合的理解」

○国立研究開発法人 日本医療研究開発機構「新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業 下痢原性細菌におけるサーベイランス手法及び病原性評価法の開発に向けた研究」(分担)

○浦上食品・食文化振興財団 研究助成金「納豆によるメチシリン耐性黄色ブドウ球菌の制御法の開発」

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その他
【社会的な活動・その他】

日本生体防御学会理事(金城)

日本感染症学会評議員(金城)

日本免疫学会評議員(金城)

日本ブドウ球菌研究会運営委員(岩瀬)

日本バイオフィルム学会評議員(杉本・奥田)

日本バイオフィルム学会広報委員(奥田)