センター長
（教授）		 金城雄樹（兼任） 教授写真
教授

臨床研究（外科系）
リーダー
大木隆生（兼任）


臨床研究（内科系）
リーダー
吉田正樹（兼任）


斎藤充（兼任）
炭山和毅（兼任）
上園晶一（兼任）
頴川晋（兼任）
岡部正隆（兼任）
國原孝（兼任）
海渡健（兼任）
荒屋潤（兼任）

岩瀬忠行（兼任）
准教授

基礎研究リーダー
杉本真也（兼任）


堀野哲也（兼任）
長堀隆一（兼任）

村井法之（兼任）
講師 田嶌亜希子（兼任）
千葉明生（兼任）
河野緑（兼任）
西條広起（兼任）
助教 林��浩史（兼任）
米本圭吾（兼任）
大学院生 原慧一郎
重盛林太郎
池上拓
訪問研究員 佐藤主税
（産業技術総合研究所）
事務局 細菌学講座内
講座（研究室）の概要
　慈恵医大・バイオフィルム研究センターは平成27年4月に発足した。本センターは、文部科学省私立大学戦略的研究基盤形成支援事業「バイオフィルム感染症制圧研究拠点の形成」（平成24-28年度）の支援を受けた研究を推進するため、本学の先端医学推進拠点群の1拠点として設立されたものである。
　バイオフィルムとは、細菌が菌体外に分泌する多糖類などのマトリクスと菌の集合体から成る構造物である。細菌が付着・増殖すると、細菌はマトリクスに覆われた状態、すなわちバイオフィルムを形成して薬剤に抵抗性を示し、また生体の防御機構からも逃れやすくなるために治療が困難になる。現在、バイオフィルム感染症は外科系診療科をはじめとしたすべての診療科において極めて重要な課題となっており、根本的な予防法・治療法の開発は急務である。本センターは基礎と臨床が共同し、臨床検体から分離したバイオフィルムの細菌叢を網羅的に解析し、バイオフィルム形成における各細菌の役割と疾患との関連性を解明することにより、バイオフィルム感染症に対する診断法・予防法の開発を行う。また、バイオフィルム形成メカニズムの解明とバイオフィルム形成を阻害する物質の探索を行い、バイオフィルム感染症治療薬の開発を目指した研究を推進する。
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教育担当

臨床基礎医学（医学科3年） ユニット「細菌・真菌と感染」
細菌学実習（医学科3年）
研究室配属（医学科3年）
選択実習（医学科6年）
症候病態演習（医学科3年）
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大学院担当科目名称
大学院ガイド授業細目　　細菌学・感染免疫学（66ページ）をご参照ください

医学研究法概論「医学論文の書き方講習会」
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主な研究テーマ
①黄色ブドウ球菌・大腸菌のバイオフィルム形成機構の解明
②大気圧走査電子顕微鏡（ASEM）および超解像顕微鏡を用いたバイオフィルムの構造解析
③バイオフィルム形成阻害薬の探索およびバイオフィルム形成を阻害する医療素材の開発
④細菌の機能性アミロイドに関する研究
⑤バイオフィルムを介した胆管ステント閉塞メカニズムの解明
⑥人工関節感染症における感染メカニズムの解明
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主な業績

（2019年以降）

  1. Sugimoto S, Kinjo Y: Instantaneous Clearing of Biofilm (iCBiofilm): an optical approach to revisit bacterial and fungal biofilm imaging. Commun Biol. 6(1):38, Jan. 2023.
  2. Kunoh T, Yamamoto T, Prasad M, Ono E, Li X, Sugimoto S, Iida E, Obana N, Takeda M, Nomura N, Utada AS: Porous pellicle formation of a filamentous bacterium, Leptothrix. Appl Environ Microbiol. 88(23):e0134122, Dec. 2022.
  3. Okuda KI, Yamada-Ueno S, Yoshii Y, Nagano T, Okabe T, Kojima H, Mizunoe Y, Kinjo Y: Small-molecule-induced activation of cellular respiration inhibits biofilm formation and triggers metabolic remodeling in Staphylococcus aureus. mBio. 13(4):e0084522, Aug. 2022.
  4. Tamura K, Chang B, Shimbashi R, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Oshima K, Maruyama T, Fujita J, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Kinjo Y, Fujikura H, Fukusumi M, Shimada T, Sunagawa T, Suzuki M, Yamamoto Y, Oishi K; Adult IPD Study Group: Dynamic changes in clinical characteristics and serotype distribution of invasive pneumococcal disease among adults in Japan after introduction of the pediatric 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in 2013-2019. Vaccine. 40(24):3338-3344, May. 2022
  5. Chiba A, Seki M, Suzuki Y, Kinjo Y, Mizunoe Y, Sugimoto S: Staphylococcus aureus utilizes environmental RNA as a building material in specific polysaccharide-dependent biofilms. NPJ Biofilms Microbiomes. 8(1):17, Apr. 2022
  6. Chang B, Tamura K, Fujikura H, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Fujita J, Oshima K, Maruyama T, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Kinjo Y, Serizawa Y, Shimbashi R, Fukusumi M, Shimada T, Sunagawa T, Suzuki M, Oishi K, Adult IPD Study Group: Pneumococcal meningitis in adults in 2014-2018 after introduction of pediatric 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in Japan. Sci Rep. 12(1):3066, Feb. 2022
  7. Dekio I, Okuda K, Nishida M, Hamada-Tsutsumi S, Suzuki T, Kinoshita S, Tamura H, Ohnuma K, Murakami Y, Kinjo Y, Asahina A: Common features and intra-species variation of Cutibacterium modestum strains, and emended description of the species. Microorganisms. 9(11):2343, Nov. 2021
  8. Abe M, Kinjo Y, Sadamoto S, Shinozaki M, Nagi M, Shibuya K, Miyazaki Y: α-galactosylceramide-stimulated invariant natural killer T-cells play a protective role in murine vulvovaginal candidiasis by Candida albicans. PLoS One. 16(11):e0259306, Nov. 2021
  9. Kanno T, Nakajima T, Kawashima Y, Yokoyama S, Asou HK, Sasamoto S, Hayashizaki K, Kinjo Y, Ohara O, Nakayama T, Endo Y: Acsbg1-dependent mitochondrial fitness is a metabolic checkpoint for tissue T reg cell homeostasis. Cell Rep. 37(6):109921, Nov. 2021
  10. Kunoh T, Yamamoto T, Sugimoto S, Ono E, Nomura N, Utada AS: Leptothrix cholodnii response to nutrient limitation. Front Microbiol. 12:691563, Jun. 2021
  11. Kanno T, Nakajima T, Yokoyama S, Asou HK, Sasamoto S, Kamii Y, Hayashizaki K, Ouchi Y, Onodera T, Takahashi Y, Ikeda K, Hasegawa Y, Kinjo Y, Ohara O, Nakayama T, Endo Y: SCD2-mediated monounsaturated fatty acid metabolism regulates cGAS-STING-dependent type I IFN responses in CD4 + T cells. Commun Biol. 4(1):820, Jun. 2021
  12. Chang B, Kinjo Y, Morita M, Tamura K, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Fujita J, Oshima K, Maruyama T, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Ohnishi M, Suga S, Oishi K, the Adult IPD Study Group: Distribution and variation of serotypes and pneumococcal surface protein A. Front Cell Infect Microbiol. 11:617573, Mar. 2021
  13. Sugimoto S, Yamanaka K, Niwa T, Terasawa Y, Kinjo Y, Mizunoe Y, Ogura T: Hierarchical model for the role of J-domain proteins in distinct cellular functions. J Mol Biol. 433(3):166750, Feb. 2021
  14. Yokoyama M, Kimura MY, Ito T, Hayashizaki K, Endo Y, Wang Y, Yagi R, Nakagawa T, Kato N, Matsubara H, Nakayama T: Myosin light chain 9/12 regulates the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Front Immunol. 11:594297, Jan. 2021
  15. Morino S, Kitagami E, Nakayama H, Koizumi Y, Tanaka-Taya K, Kinjo Y, Oishi K: Seroepidemiological analysis of anti-pneumococcal surface protein A (PspA) immunoglobulin G by clades in Japanese population. Vaccine. 38(47): 7479-84, Nov. 2020
  16. Hoshina T, Aonuma H, Ote M, Sakurai T, Saiki E, Kinjo Y, Kondo K, Okabe M, Kanuka H: Intensive diagnostic management of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in academic settings in Japan: challenge and future. Inflamm Regen. 40: 38, Oct. 2020
  17. Kunoh T, Morinaga K, Sugimoto S, Miyazaki S, Toyofuku M, Iwasaki K, Nomura N, Utada AS: Polyfunctional nanofibril appendages mediate attachment, filamentation, and filament adaptability in Leptothrix cholodnii. ACS Nano. 14(5):5288-97, May. 2020
  18. Lopes AA, Yoshii Y, Yamada S, Nagakura M, Kinjo Y, Mizunoe Y, Okuda K: Roles of lytic transglycosylases in biofilm formation and β-lactam resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother. 63(12):e01277-19, Sep. 2019
  19. Yonemoto K, Chiba A, Sugimoto S, Sato C, Saito M, Kinjo Y, Marumo K, Mizunoe Y: Redundant and distinct roles of secreted protein Eap and cell wall-anchored protein SasG in biofilm formation and pathogenicity of Staphylococcus aureus. Infect Immun. 87(4):e00894-18, Apr. 2019
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主な競争的研究費
  • JST創発的研究支援事業
    「アミロイドの制御分子から開拓する感染症・神経変性疾患の融合領域研究」

  • 文部科学省科学研究費補助金・新学術領域研究（研究領域提案型）
    「iBC法を用いたポストコッホ微生物集団の活写」

  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（B）一般
    「新規肺炎球菌ワクチンのNKT細胞を介する抗体産生誘導及び感染防御の持続機構の解明」

  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（B）一般
    「バイオフィルム形成における菌体外マトリクス成分のムーンライト機能の解明」

  • 文部科学省科学研究費補助金・挑戦的研究（萌芽）
    「アミロイドーシスの発症を誘導する腸内細菌由来機能性アミロイドの探索」

  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（C）一般
    「常在細菌からの創薬〜宿主誘導性の抗菌作用の解析と応用」

  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（C）一般
    「長期抗体産生を誘導する機能的NKT細胞の発生機序の解明」

  • 大山健康財団 学術研究助成金
    「バイオフィルム形成機構の解明及び制御法の開発」

  • 発酵研究所 一般研究助成
    「DnaKシャペロンシステムの機能的ヒエラルキーを規定する分子基盤の解明」

【社会的な活動・その他】
  • 日本バイオフィルム学会評議員（金城・杉本）
  • 日本バイオフィルム学会広報委員副委員長（杉本）
  • 日本微生物連盟理事（金城）
  • 日本細菌学会理事（金城）
  • 日本生体防御学会理事（金城）
  • 日本感染症学会評議員（金城）
  • 日本化学療法学会評議員（金城）
  • 日本免疫学会評議員（金城）
  • 日本医真菌学会代議員（金城）
  • 日本細菌学会関東支部評議員（金城）
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