センター長 金城雄樹（兼任）
研究コア・リーダー

大木隆生（兼任）

吉田正樹（兼任）
事務局 細菌学講座内
講座（研究室）の概要
　慈恵医大・バイオフィルム研究センターは平成27年4月に発足した。本センターは、文部科学省私立大学戦略的研究基盤形成支援事業「バイオフィルム感染症制圧研究拠点の形成」（平成24-28年度）の支援を受けた研究を推進するため、本学の先端医学推進拠点群の1拠点として設立されたものである。
　バイオフィルムとは、細菌が菌体外に分泌する多糖類などのマトリクスと菌の集合体から成る構造物である。細菌が付着・増殖すると、細菌はマトリクスに覆われた状態、すなわちバイオフィルムを形成して薬剤に抵抗性を示し、また生体の防御機構からも逃れやすくなるために治療が困難になる。現在、バイオフィルム感染症は外科系診療科をはじめとしたすべての診療科において極めて重要な課題となっており、根本的な予防法・治療法の開発は急務である。本センターは基礎と臨床が共同し、臨床検体から分離したバイオフィルムの細菌叢を網羅的に解析し、バイオフィルム形成における各細菌の役割と疾患との関連性を解明することにより、バイオフィルム感染症に対する診断法・予防法の開発を行う。また、バイオフィルム形成メカニズムの解明とバイオフィルム形成を阻害する物質の探索を行い、バイオフィルム感染症治療薬の開発を目指した研究を推進する。
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センターの2つのコア
バイオフィルム基礎研究コア
・細菌叢解析班（責任者：奥田賢一）
奥田賢一（細菌）、岩瀬忠行（基盤）
・分子メカニズム研究班（責任者：杉本真也）
岩本武夫（基盤）、高田耕司（生物）、千葉明生（細菌）、林��浩史（細菌）、 米本圭吾（整外）、上井康寛（大学院生）
・創薬基盤研究・バクテリオシン利用技術研究班（責任者：奥田賢一）
田嶌亜紀子（細菌）、村井法之（分子生物）、吉井悠（呼内）
・高分解能観察技術開発班（責任者：杉本真也）
岡部正隆（解剖）、奥田賢一（細菌）、千葉明生（細菌）、佐藤主税（産業技術総合研究所）、西條広起（解剖）　

バイオフィルム感染症研究コア（リーダー：大木隆生・吉田正樹）
・臨床検体解析班（責任者：大木隆生）
上園晶一（麻酔）、頴川晋（泌尿）、國原孝（心外）、斎藤充（整外）、炭山和毅（内視鏡）、長堀隆一（心外）、古橋広人（内視鏡）
・臨床応用技術開発班（責任者：堀野哲也）
海渡健（中検）、河野緑（臨検）、荒屋潤（呼内）

機構の概略（2020年7月現在）
センター長
金城雄樹（細菌学講座）
研究コアリーダー
大木隆生（外科）、吉田正樹（感染）
研究メンバー
上園晶一（麻酔）、頴川晋（泌尿）、岡部正隆（解剖）、國原孝（心外）、斎藤充（整外）、炭山和毅（内視鏡）、海渡健（中検）、高田耕司（生物）、岩本武夫（基盤）、堀野哲也（感染）、杉本真也（細菌）、田嶌亜紀子（細菌）、奥田賢一（細菌）、長堀隆一（心外）、荒屋潤（呼内）、佐藤主税（産業技術総合研究所）、村井法之（分子生物）、河野緑（臨検）、岩瀬忠行（基盤）、林��浩史（細菌）、吉井悠（呼内）、米本圭吾（整外）、上井康寛（大学院生）、西條広起（解剖）、古橋広人（内視鏡）
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主な研究テーマ
①黄色ブドウ球菌・大腸菌のバイオフィルム形成機構の解明
②大気圧走査電子顕微鏡（ASEM）および超解像顕微鏡を用いたバイオフィルムの構造解析
③バイオフィルム形成阻害薬の探索およびバイオフィルム形成を阻害する医療素材の開発
④細菌の機能性アミロイドに関する研究
⑤バイオフィルムを介した胆管ステント閉塞メカニズムの解明
⑥人工関節感染症における感染メカニズムの解明
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主な業績

（2019年以降）

  1. Tamura K, Chang B, Shimbashi R, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Oshima K, Maruyama T, Fujita J, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Kinjo Y, Fujikura H, Fukusumi M, Shimada T, Sunagawa T, Suzuki M, Yamamoto Y, Oishi K; Adult IPD Study Group: Dynamic changes in clinical characteristics and serotype distribution of invasive pneumococcal disease among adults in Japan after introduction of the pediatric 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in 2013-2019. Vaccine. 40(24):3338-3344, May. 2022
  2. Chiba A, Seki M, Suzuki Y, Kinjo Y, Mizunoe Y, Sugimoto S: Staphylococcus aureus utilizes environmental RNA as a building material in specific polysaccharide-dependent biofilms. NPJ Biofilms Microbiomes. 8(1):17, Apr. 2022
  3. Chang B, Tamura K, Fujikura H, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Fujita J, Oshima K, Maruyama T, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Kinjo Y, Serizawa Y, Shimbashi R, Fukusumi M, Shimada T, Sunagawa T, Suzuki M, Oishi K, Adult IPD Study Group: Pneumococcal meningitis in adults in 2014-2018 after introduction of pediatric 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in Japan. Sci Rep. 12(1):3066, Feb. 2022
  4. Dekio I, Okuda K, Nishida M, Hamada-Tsutsumi S, Suzuki T, Kinoshita S, Tamura H, Ohnuma K, Murakami Y, Kinjo Y, Asahina A: Common features and intra-species variation of Cutibacterium modestum strains, and emended description of the species. Microorganisms. 9(11):2343, Nov. 2021
  5. Abe M, Kinjo Y, Sadamoto S, Shinozaki M, Nagi M, Shibuya K, Miyazaki Y: α-galactosylceramide-stimulated invariant natural killer T-cells play a protective role in murine vulvovaginal candidiasis by Candida albicans. PLoS One. 16(11):e0259306, Nov. 2021
  6. Kanno T, Nakajima T, Kawashima Y, Yokoyama S, Asou HK, Sasamoto S, Hayashizaki K, Kinjo Y, Ohara O, Nakayama T, Endo Y: Acsbg1-dependent mitochondrial fitness is a metabolic checkpoint for tissue T reg cell homeostasis. Cell Rep. 37(6):109921, Nov. 2021
  7. Kunoh T, Yamamoto T, Sugimoto S, Ono E, Nomura N, Utada AS: Leptothrix cholodnii response to nutrient limitation. Front Microbiol. 12:691563, Jun. 2021
  8. Kanno T, Nakajima T, Yokoyama S, Asou HK, Sasamoto S, Kamii Y, Hayashizaki K, Ouchi Y, Onodera T, Takahashi Y, Ikeda K, Hasegawa Y, Kinjo Y, Ohara O, Nakayama T, Endo Y: SCD2-mediated monounsaturated fatty acid metabolism regulates cGAS-STING-dependent type I IFN responses in CD4 + T cells. Commun Biol. 4(1):820, Jun. 2021
  9. Chang B, Kinjo Y, Morita M, Tamura K, Watanabe H, Tanabe Y, Kuronuma K, Fujita J, Oshima K, Maruyama T, Abe S, Kasahara K, Nishi J, Kubota T, Ohnishi M, Suga S, Oishi K, the Adult IPD Study Group: Distribution and variation of serotypes and pneumococcal surface protein A. Front Cell Infect Microbiol. 11:617573, Mar. 2021
  10. Sugimoto S, Yamanaka K, Niwa T, Terasawa Y, Kinjo Y, Mizunoe Y, Ogura T: Hierarchical model for the role of J-domain proteins in distinct cellular functions. J Mol Biol. 433(3):166750, Feb. 2021
  11. Yokoyama M, Kimura MY, Ito T, Hayashizaki K, Endo Y, Wang Y, Yagi R, Nakagawa T, Kato N, Matsubara H, Nakayama T: Myosin light chain 9/12 regulates the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Front Immunol. 11:594297, Jan. 2021
  12. Morino S, Kitagami E, Nakayama H, Koizumi Y, Tanaka-Taya K, Kinjo Y, Oishi K: Seroepidemiological analysis of anti-pneumococcal surface protein A (PspA) immunoglobulin G by clades in Japanese population. Vaccine. 38(47): 7479-84, Nov. 2020
  13. Hoshina T, Aonuma H, Ote M, Sakurai T, Saiki E, Kinjo Y, Kondo K, Okabe M, Kanuka H: Intensive diagnostic management of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in academic settings in Japan: challenge and future. Inflamm Regen. 40: 38, Oct. 2020
  14. Kunoh T, Morinaga K, Sugimoto S, Miyazaki S, Toyofuku M, Iwasaki K, Nomura N, Utada AS: Polyfunctional nanofibril appendages mediate attachment, filamentation, and filament adaptability in Leptothrix cholodnii. ACS Nano. 14(5):5288-97, May. 2020
  15. Lopes AA, Yoshii Y, Yamada S, Nagakura M, Kinjo Y, Mizunoe Y, Okuda K: Roles of lytic transglycosylases in biofilm formation and β-lactam resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother. 63(12):e01277-19, Sep. 2019
  16. Okai C, Itani Y, Furuta A, Mizunoe Y, Iwase T: Rapid identification and quantification of Lactobacillus rhamnosus by real-time PCR using a TaqMan probe. Jpn J Infect Dis. 72(5):323-325, Sep. 2019
  17. Yonemoto K, Chiba A, Sugimoto S, Sato C, Saito M, Kinjo Y, Marumo K, Mizunoe Y: Redundant and distinct roles of secreted protein Eap and cell wall-anchored protein SasG in biofilm formation and pathogenicity of Staphylococcus aureus. Infect Immun. 87(4):e00894-18, Apr. 2019
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主な競争的研究費
  • 文部科学省科学研究費補助金・国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A))「アミロイド性バイオフィルムのマトリクス形成制御」
  • 文部科学省科学研究費補助金・新学術領域研究（研究領域提案型）「iBC法を用いたポストコッホ微生物集団の活写」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（B）「高親和性抗体の産生及び持続をもたらす免疫応答の解明とワクチンへの応用」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（B）「新規肺炎球菌ワクチンのNKT細胞を介する抗体産生誘導及び感染防御の持続機構の解明」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（B）「バイオフィルム形成における菌体外マトリクス成分のムーンライト機能の解明」
  • 文部科学省科学研究費補助金・挑戦的研究（萌芽）「アミロイドーシスの発症を誘導する腸内細菌由来機能性アミロイドの探索」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（C）「細胞壁ターンオーバーを介した黄色ブドウ球菌の薬剤耐性と抵抗性の包括的制御」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（C）「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌に対する薬剤耐性改変剤の探索と作用機序研究」
  • 文部科学省科学研究費補助金・基盤研究（C）「長期抗体産生を誘導する機能的NKT細胞の発生機序の解明」
  • 文部科学省科学研究費補助金・若手研究「グルコース誘導体による黄色ブドウ球菌感染症の治療法の開発」
  • 厚生労働科学研究費補助金（新興・再興感染症及び予防接種政策推進研究事業）「成人の侵襲性細菌感染症サーベイランスの充実化に資する研究」（分担）
  • 武田科学振興財団 研究助成金「細胞壁ターンオーバー因子を標的としたMRSA薬剤耐性改変剤の開発」
  • 大山健康財団 学術研究助成金「バイオフィルム形成機構の解明及び制御法の開発」
  • テルモ生命科学振興財団 研究開発助成金「感染防御効果の持続性に優れた新規肺炎球菌ワクチンの開発」
  • かなえ医薬振興財団助成金「濾胞性ヘルパーNKT細胞の機能的マスター転写因子の同定」
  • 東京慈恵会医科大学医学研究科研究推進費「腸管を起点とする播種性感染症の発症機構の解明」
  • 東京慈恵会医科大学萌芽的共同研究推進費「人工関節感染症における感染メカニズムの解明」
  • 東京慈恵会医科大学大学間共同研究プロジェクト「ワクチンで誘導される特異的抗体の「Quality」の解析」

【社会的な活動・その他】
日本バイオフィルム学会評議員（金城・杉本・奥田）
日本バイオフィルム学会広報委員（杉本・奥田）
日本微生物連盟理事（金城）
日本細菌学会理事（金城）
日本生体防御学会理事（金城）
日本感染症学会評議員（金城）
日本化学療法学会評議員（金城）
日本免疫学会評議員（金城）
日本医真菌学会代議員（金城）
日本細菌学会関東支部評議員（金城）
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