東京慈恵会医科大学は、大正10（1921）年に財団法人東京慈恵会医科大学を設置し、昭和26（1951）年に学校法人慈恵大学と改めた。正式には学校法人慈恵大学・東京慈恵会医科大学と呼ばれる。学校法人慈恵大学が関与する事業には、東京慈恵会医科大学医学部（医学科・看護学科）、東京慈恵会医科大学大学院（医学研究科・看護学研究科）、慈恵第三看護専門学校、慈恵柏看護専門学校および４つの大学附属病院（本院・葛飾医療センター・第三病院・柏病院）があり、それらが一体となって教育、研究、医療に寄与している。

＊慈恵看護専門学校は公益社団法人東京慈恵会が運営している。